植物在罹病后，除在外部形态上发生病变外，其内部也常发生变化。例如，受病毒侵染时，植物细胞内常有内含体(inc/usion，intlusion body)出现；当受侵染维管柬的真菌侵染时，在组织内常有侵填体(tylose，tylosis)和胼胝质( callose)增加的现象。 

内含体形态多样，常呈风轮状、环状和带状颗粒，可在光学显微镜下看到。根据组成，内含体可分为不定形内含体和晶体状内含体，前者南病毒粒体和寄主细胞成分混合组成，后者一般是由病毒粒体整齐排列堆叠而成。侵填体又称填充体，它是由术质部的薄壁细胞穿过纹孔向邻接的导管或管胞腔内长出的瘤状突起。其储藏的单宁、树脂等物质能增强木质部的硬度，最终使导管或管胞液流透性降低，失去输导能力，并对病菌在导管内的扩展起到物理屏障作用。胼胝质是围绕每个筛孔的边缘积累的碳水化合物。当胼胝质在筛管端壁上越积越多时，会形成被称为肼胝体( callosity)的垫状物。温带的树木在进入冬季时，胼胝质形成，堵塞筛管的筛孔。但到翌年春季，这种胼胝体被酶溶解而恢复其运输功能。在抗病品种中，当病原物侵入时，其筛管也形成大量胼胝体，从而堵塞筛管，阻止病菌扩展。