森林破坏也是二氧化碳排放的重要来源之一。植物吸收二氧化碳来生长，但枯萎、腐烂或燃烧后便会释放出来。植物腐烂也会产生比二氧化碳更厉害的温室气体－甲烷。所以，可吸收二氧化碳的树木同时减少，温室气体便会释放出来(例如森林火灾、或燃烧薪柴)。森林采伐和退化可以说是双重的破坏。过去150年，三成的二氧化碳释放是来自森林采伐，不过相比全球森林所储存的碳，仍是一个小数目。单是加拿大和俄罗斯的温带森林便储存了世界四成的碳存量。
如今，毁林所造成的温室气体排放约占全球温室气体排放总量的五分之一。泥炭沼泽森林的破坏是印尼二氧化碳高排放量的主要原因。根据近期评估数字显示，印尼已经成为继中国、美国之后的第三大温室气体排放国。
联合国政府间气候变化专门委员会（IPCC）的研究显示，要避免气候变化对全球造成严重危害，就必须大幅削减与能源相关的温室气体排放量，并全面停止森林破坏。
气候变化伤害森林
温差和降雨变化可以伤害森林。由于气候变化，预计将来可能会发生更频密的旱灾和森林火灾。森林火灾本来是森林生态循环的正常现象，因为可以清除茂密的灌木林，而且也是部分生物生命周期的规律条件。可是，种种迹象显示，巴西亚马逊森林正在枯竭，火灾和沙漠化严重威胁森林。
病虫害也可伤害森林。昆虫是森林生态的重要部分，它可分解废弃物、提供粮食给鸟类和小动物，并清除生病的树木。但是在较暖和较干燥的气候条件下，有害昆虫攻击森林的频率日益增加。一些原本受制于寒冷气候的病虫害，正在大量繁殖扩散。
减少毁林和可持续林业
值得注意的是，适当的可持续林业经营并不会引起大气层二氧化碳的增加。保护原始森林、推行可持续林业，这些对减缓气候变化都十分重要。
要保护世界的原始森林，你可以选择购买由林业管理公会认可的木材，及利用循环再造物料的木材产品。所以你既可以拯救重要生物栖息地，也可有利于气候。
